PT小鬼群の対策も踏まえて、今後の改修の目標を忘れないようメモしておきます。
完全に自分用なので細かい説明は省きます。(多分参考にならないと思います)

2016/01/26 追記:改修した装備のリストを追加しました。
2016/01/26 追々記:自分の目標リストを追記しました。火力計算を追加しました。
2016/02/10 追記:イベント前夜の装備リストに更新しました。 

改修について
改修工廠 - 艦隊これくしょん -艦これ- 攻略 Wiki*
細かい説明はwikiに丸投げします。

艦これ改修工廠通知bot・資料置き場
このbotについて

メイン機能:改修品目通知
改修工廠で改修可能な装備と担当艦娘 (2番艦) を、曜日ごとに1日3回 (0時・5時・21時) ツイートします。
装備や担当艦娘が追加・変更された場合、ツイートの内容は曜日ごとに朝の更新となります。
※中の人の都合で日付変更直後になったり夜になったりする場合があります
21時のみ、翌日分の情報も続けてツイートします。

Twitterで毎日その日の改修可能な装備をツイートしてくれるので便利なので紹介です。

メモ
・PT小鬼群対策のOTO副砲は★9をとりあえず2本作ったので今後は機銃を改修する。他に何もない日はOTO副砲を上げる。
・PT小鬼群対策の駆逐装備は主主見張り主主機銃でいいが、軽巡の装備をどうするか…
15.2改OTO観測機かOTO*2電探にするかでOTOが足りないので改修優先度を変える必要がある(副砲無しも検討)。
・ソナーは装備消費がきついので余裕が無いときは優先度を無視する。
・素材の41cm砲は現時点で12本あるが、なくなったら優先度を無視する。
・ 火曜、水曜、木曜が被っててきつめ。金曜、土曜は逆に改修したいものが少ないため、終わったら機銃、電探を改修する
・38cm連装砲改、10cm高角砲+高射装置はもうすぐ終わり、目標到達する。終わればリストがかなり削れるのでそのとき見直す。
・試製51cm、46cmは素材不足なので一時中断

もし需要があれば自分の装備一覧をまとめる。
→一応まとめました

PT小鬼群について検証されている方のブロマガです。
PT小鬼群検証:伊月のブロマガ - ブロマガ

2016/01/26 追記 

 おそらく誰も見ないと思い完全に自分用として書いてましたが、たまに見てくれる方がいて、本当になにも参考にならないのが申し訳なく思ったので、とりあえず所持装備から改修してある装備だけをまとめておきました。装備改修で迷ったらこの中から選ぶのもいいと思います。リストには入ってませんが32号電探と機銃はこれからやるところです。
2016/02/10更新したので格納しました。
詳細を表示
名称種別個数改修値
三式水中探信儀ソナー29★4x2,無改修x27
四式水中聴音機ソナー2★4x2
61cm四連装(酸素)魚雷魚雷57★1x14,無改修x43
61cm五連装(酸素)魚雷魚雷9★7x1,★6x3,★5x1,★4x4
61cm三連装(酸素)魚雷魚雷6★4x3,無改修x3
10cm連装高角砲+高射装置高角砲6★9x4,★6x1,★4x1
94式高射装置高射装置2★9x1,無改修x1
12.7cm連装砲B型改二小口径主砲13★1x2,無改修x11
12.7cm連装砲小口径主砲6★4x1,無改修x5
35.6cm連装砲大口径主砲17★9x4,無改修x13
41cm連装砲大口径主砲14★9x2,★2x2,無改修x10
46cm三連装砲大口径主砲7★2x2,★1x2,無改修x3
381mm/50 三連装砲改大口径主砲4★4x4
38cm連装砲改大口径主砲4★9x2,★6x1,★4x1
試製51cm連装砲大口径主砲2★4x2
96式150cm探照灯探照灯1★4x1
探照灯探照灯1★9x1
20.3cm(3号)連装砲中口径主砲16★9x1,★7x4,★6x3,★4x8
20.3cm(2号)連装砲中口径主砲15★4x1,★1x10,無改修x4
15.2cm連装砲改中口径主砲2★9x1,無改修x1
一式徹甲弾徹甲弾2★7x1,★4x1
九一式徹甲弾徹甲弾2★4x2
13号対空電探改電波探信儀14★4x2,無改修x12
22号対水上電探改四電波探信儀5★4x1,★1x2,無改修x2
三式爆雷投射機爆雷投射機9★4x1,★2x1,★1x2,無改修x5
OTO 152mm三連装速射砲副砲5★9x2,無改修x3

2016/02/10時点での改修した装備リスト 追記

名称種別個数改修値
三式水中探信儀ソナー29★4x2,無x27
四式水中聴音機ソナー2★4x2
25mm三連装機銃機銃12★2x2,無x10
61cm五連装(酸素)魚雷魚雷9★7x1,★6x5,★4x3
61cm三連装(酸素)魚雷魚雷6★4x3,無x3
61cm四連装(酸素)魚雷魚雷57★1x14,無x43
10cm連装高角砲+高射装置高角砲6★9x4,★6x1,★4x1
94式高射装置高射装置2★9x1,無x1
12.7cm連装砲小口径主砲5★4x1,無x4
12.7cm連装砲B型改二小口径主砲13★1x2,無x11
35.6cm連装砲大口径主砲11★9x4,無x7
381mm/50 三連装砲改大口径主砲4★4x4
38cm連装砲改大口径主砲4★10x2,★7x2
41cm連装砲大口径主砲9★9x2,★2x2,無x5
46cm三連装砲大口径主砲7★2x2,★1x2,無x3
試製51cm連装砲大口径主砲2★4x2
96式150cm探照灯探照灯1★4x1
探照灯探照灯1★9x1
15.2cm連装砲改中口径主砲2★9x1,無x1
20.3cm(2号)連装砲中口径主砲15★4x1,★1x10,無x4
20.3cm(3号)連装砲中口径主砲16★9x1,★7x4,★6x4,★4x7
一式徹甲弾徹甲弾2★7x1,★4x1
九一式徹甲弾徹甲弾4★4x2,無x2
13号対空電探改電波探信儀15★4x2,無x13
22号対水上電探改四電波探信儀5★4x1,★1x2,無x2
三式爆雷投射機爆雷投射機9★4x1,★2x1,★1x2,無x5
OTO 152mm三連装速射砲副砲5★9x2,無x3

当面の目標をリスト化しました。目標と優先度は自分用です。
  • 三式水中探信儀、四式水中聴音機
    1艦隊分の対潜セットとして4式ソナーと合わせて合計12個をとりあえず★4まで上げる。優先度高
  • 61cm四連装(酸素)魚雷
    目標無し、ローテの潜水艦用なのでこれ以上の改修はしない。優先度無
  • 61cm五連装(酸素)魚雷
    当面は全てを★6まで、素材ができたら★7と★6をセットで積めるようにする。優先度高
  • 61cm三連装(酸素)魚雷
    潜水艦用にあと1個を★4まで上げる。優先度低
  • 10cm連装高角砲+高射装置
    全てを★9まであげる。優先度高
  • 94式高射装置
    目標なし、何個か更新して長10cm砲+高射装置を作ったのであとは他の装備に回す。優先度無
  • 12.7cm連装砲B型改二
    目標なし、10cm連装高角砲+高射装置があるのでほとんど出番なし。優先度無
  • 12.7cm連装砲
    目標なし、火力検証用に★をつけただけ。優先度無
  • 35.6cm連装砲
    大口径主砲は★MAXを目指す、優先度低
  • 41cm連装砲
    大口径主砲は★MAXを目指す。38cm連装砲改の改修が終わったら再開。優先度中
  • 46cm三連装砲
    素材不足なので試製51cm優先、優先度極低
  • 381mm/50 三連装砲改
    射程超長、フィット的には悪く無いが素材が41cmなので優先度低
  • 38cm連装砲改
    大口径主砲は★MAXを目指す、優先度超高
  • 試製51cm連装砲
    大口径主砲は★MAXを目指す、優先度高(素材があれば)
  • 96式150cm探照灯
    とりあえずは現状維持、優先度高(素材があれば)
  • 探照灯
    目標達成。複数積むメリットが出れば改修する。優先度無
  • 20.3cm(3号)連装砲
    当面は全てを★6まで、素材ができたら★7と★6をセットで積めるようにする、優先度高
  • 20.3cm(2号)連装砲
    3号砲を優先するため現状維持、優先度低
  • 15.2cm連装砲改
    とりあえず★9まで上げる、優先度高
  • 一式徹甲弾
    大口径主砲★MAXとセットで積むなら★7または★8まででいい、深刻な素材不足により現状維持。優先度高(素材があれば)
  • 九一式徹甲弾
    大口径主砲★MAXとセットで積むなら★7または★8まででいい、優先度高(素材があれば)
  • 13号対空電探改
    電探改修は目標が難しい、優先度低(素材があれば)
  • 22号対水上電探改四
    電探改修は目標が難しい、優先度低(素材があれば)
  • 三式爆雷投射機
    1艦隊分の対潜セットとして合計6個ぐらい★4まであげたい。優先度高
  • OTO 152mm三連装速射砲
    PT対策としてあと合計4個ぐらい★9まであげたい。優先度高
  • 25mm三連装機銃
    PT対策として合計4個ぐらい改修する。優先度高?
  • 32号水上電探 系
    電探改修は目標が難しい、優先度中(素材があれば)

大口径主砲と徹甲弾の改修について

 大口径主砲と徹甲弾を両方積む場合の、改修による火力上昇の最大値の計算です(切り捨てで計算)大口径主砲の装備別補正値は1.5、徹甲弾は1.0として計算しました。(砲撃戦)
1.5 √(10)*2+1.0√(6) =11.9363227233
1.5 √(10)*2+1.0√(7) =12.1325842916
1.5 √(10)*2+1.0√(8) =12.3152601053
1.5 √(10)*2+1.0√(9)略
1.5 √(10)*2+1.0√(10)=12.6491106407

※括弧の中は改修値です
 以上より、大口径主砲★MAX*2徹甲弾1の積み方の場合、改修による火力上昇を考慮すると徹甲弾の改修は★7まででよいことがわかります。
 ただし、改修による命中の上昇値は別計算なので★MAXまで上げるメリットが無いわけではありません。

 一式徹甲弾の入手が非常に大変なので★7止めにするために大口径主砲を★MAXまであげるのも、一応ありだとは思いました。 

 夜戦の場合で大口径主砲の補正値を1.0として計算すると、
1.0 √(10)*2+1.0√(7) =8.9703066314
1.0 √(10)*2+1.0√(8) =9.152982445081
1.0 √(10)*2+1.0√(9)略
1.0 √(10)*2+1.0√(10)=9.48683298051
となり、大口径主砲を★MAXまであげるならば徹甲弾は★8で火力+9に届きます。

 ちなみに改修★9止めだと、
砲撃戦
1.5 √(9)*2+1.0√(9)=12
夜戦
1.0 √(9)*2+1.0√(9)=9
これが火力上昇の最大値となります。
面倒なら全部★9にするのが手っ取り早いです。

1週間の曜日別改修リスト(自分用抜粋)です。基本は太字を改修します。
上のほうが優先度高で終われば下の装備を改修する、割りと適当な優先度です。
  • 日曜日
    • 38cm連装砲改(Bismarck)
    • 三式水中聴音器(秋月)
    • 15.2cm連装砲改(酒匂)
    • 10cm高角砲+高射装置(照月)
  • 月曜日
    • 38cm連装砲改(Bismarck)
    • 15.2cm連装砲改(酒匂)
    • 10cm高角砲+高射装置(秋月)
  • 火曜日
    • 20.3cm(3号)連装砲(三隈)
    • 38cm連装砲改(Bismarck)
    • 三式水中聴音器(五十鈴改二、夕張)
    • 15.2cm連装砲改(酒匂)
    • 10cm高角砲+高射装置(秋月)
  • 水曜日
    • 61cm五連装(酸素)魚雷(島風)
    • 三式爆雷投射機(五十鈴改二)
    • 三式水中聴音器(五十鈴改二、夕張)
    • 20.3cm(3号)連装砲(三隈)
    • 15.2cm連装砲改(矢矧)
    • 10cm高角砲+高射装置(秋月)
  • 木曜日
    • 61cm五連装(酸素)魚雷(島風)
    • 三式爆雷投射機(五十鈴改二)
    • 15.2cm連装砲改(矢矧)
    • 10cm高角砲+高射装置(秋月、照月)
  • 金曜日
    • 25mm三連装機銃(摩耶改二)
    • 15.2cm連装砲改(矢矧)
    • 10cm高角砲+高射装置(照月)
  • 土曜日 
    • 25mm三連装機銃(摩耶改二)
    • 15.2cm連装砲改(阿賀野、能代)
    • 10cm高角砲+高射装置(照月)